《好奇探长》的故事发生在地球上某个鸟语花香的地方，有个天使小镇。天使小镇上，生活着一群快乐的孩子。我们的主角，好奇丁，从小就是个好奇宝宝，什么都要弄个一清二楚，时间久了，自然懂得非常丰富的课外知识，他崇拜并且学习所有的大侦探。他与镇上的小孩布丁、豆丁，建立了布豆丁侦探团，探查一些在这个小镇上孩子们的生活中发生的神秘案件。基本上这些案件都不是刑事犯罪，是自然科学或者因为知识面不广造成的“迷案”。就这样，好奇探长好奇丁、科学达人豆丁、美丽名捕布丁三人齐心，以他们的超凡实力，一步步走上名侦探的闪亮大道！