昭和12年。乘坐在前往中国大陆列车上双亲被关东军杀害的少年鹰村大志（声：区瑞华）受到异星人的袭击。一方面日本军通过分析异星人的技术，生产出3部巨大的机器人，并组建了“机神兵团”；另一方面，敌人也在人类当中渐渐扩充势力。